美國加利福尼亞州斯坦福大學的Les Dethlefsen和David Relman在10個月期間，採集了3個人的50多份糞便標本，此期間這三個人接受了兩個療程抗生素環丙沙星的治療。他們用基因測序來確定每份標本中的微生物株。他們發現每個人的腸道微生物群都是獨特的，其組成總體平衡，略有增減，但每個療程的藥物治療都會打破這種平衡。

在大多數情況下，腸道微生物群的組成很快恢復原來的狀態，但在一些情況下，治療前的菌種被有關的菌種所代替。一位受試者接受環丙沙星治療後完全失去了一種普通細菌，在研究期間再也沒有恢復。論文發表於《國家科學院院刊》（PNAS）。

Dethlefsen說，每一療程的抗生素治療都像擲骰子，可能導致腸道微生物的持久改變。由於腸道菌群的改變會增加一些慢性疾病的風險，因此每個療程的抗生素治療都可能是短期收益與長期風險的博弈。